Friki Work

El análisis de datos de secuenciación de ARN con resolución espacial requiere la aplicación de flujos de trabajo que fusionen la información molecular con las coordenadas histológicas. Este proceso abarca la normalización, el agrupamiento no supervisado, la detección de patrones de variabilidad espacial y la integración con transcriptómica de c ...

El procesamiento enicial de los datos de secuenciación de ARN de célula única (scRNA-seq) es crítico para garantizar la validez de los análisis posteriores. Este flujo de trabajo se centra en la carga de datos provenientes de 10X Genomics, la aplicación de filtros de calidad y la eliminación sistemática de dobletes mediante herramientas bioinfo ...

Tejido pulmonar humano: Nanostring CosMx Spatial Molecular Imager Este conjunto de datos fue generado mediante el Spatial Molecular Imager (SMI) de Nanostring CosMx, una tecnología que permite el análisis multiplexado de moléculas individuales, detectando tanto ARN como proteínas directamente en tejidos fijados e incluidos en parfaina (FFPE). I ...

Objetivos de aprendizaje Comprender cómo importar y leer datos de secuenciación de ARN de célula única (scRNA-seq), realizar un control de calidad adecuado y preparar los datos para el aálisis posterior. 1. Preparación para el control de calidad Tras la cuantificación de la expresión génica, es necesario importar estos datos en R para generar l ...

Tejido pulmonar humano: Nanostring CosMx Spatial Molecular Imager Este conjunto de datos fue generado mediante el Spatial Molecular Imager (SMI) de Nanostring CosMx, una tecnología que permite el análisis multiplexado de moléculas individuales, detectando tanto ARN como proteínas directamente en tejidos fijados e incluidos en parfaina (FFPE). I ...